对于您关于预备党员超过预备期后转组织关系及转正的问题，通常情况下，党组织关系的转接与预备党员的转正是两个紧密关联但性质不同的程序。根据相关规定，预备党员的预备期一般为一年，其转正手续通常应在预备期满时由所在党支部及时办理。若预备期已过，相关程序的合规性会变得复杂，需要具体情况具体分析。

以下是对您问题的具体分析：

法律依据

《中国共产党章程》第七条

“预备党员的预备期为一年。党组织对预备党员应当认真教育和考察。预备党员的义务同正式党员一样。预备党员的权利，除了没有表决权、选举权和被选举权以外，也同正式党员一样。预备党员预备期满，党的支部应当及时讨论他能否转为正式党员。认真履行党员义务，具备党员条件的，应当按期转为正式党员；需要继续考察和教育的，可以延长预备期，但不能超过一年；不履行党员义务，不具备党员条件的，应当取消预备党员资格。预备党员转为正式党员，或延长预备期，或取消预备党员资格，都应当经支部大会讨论通过和上级党组织批准。”

适用解释：该条款明确了预备党员的预备期、转正程序以及相关处理方式。核心在于，预备党员的转正必须由所在党支部在预备期满后及时讨论，并报上级党组织批准。超过预备期后，转正程序的启动主体和程序合规性将面临挑战。

《中国共产党发展党员工作细则》第三十三条

“预备党员因工作、学习所在单位（居住地）发生变动，应当及时报告原所在党组织。原所在党组织应当及时将对其培养教育和考察的情况，认真负责地介绍给接收预备党员的党组织。党组织应当对转入的预备党员的入党材料进行严格审查，对无法认定的预备党员，报县级以上党委组织部门批准，不予承认。”

适用解释：该条款规定了预备党员组织关系转接的程序。关键在于，接收党组织需要对转入预备党员的入党材料进行严格审查。如果预备期已过，其转正问题将直接影响组织关系的接收和审查。

问题分析

您的问题核心在于“超过预备期”这一时间因素对转组织关系和转正的影响。

预备期与转正的关系：预备党员的预备期是固定的，一般为一年。预备期满后，党支部应及时讨论其转正问题。如果超过预备期仍未讨论，属于程序上的瑕疵，需要由原党组织说明情况并补办相关手续。

转组织关系与转正的关系：预备党员的组织关系转接，是将其党员身份和培养教育责任从一个党组织转移到另一个党组织。接收党组织在审查其材料时，会重点关注其预备期是否已满、是否已办理转正手续。如果预备期已过且未转正，接收党组织可能无法直接接收其组织关系，或需要原党组织提供相关说明。

“超过预备期”的后果：预备期超过后，其转正程序将变得复杂。原党组织需要说明为何未按期讨论转正，并可能需要补办相关手续。如果预备期过长（例如超过一年），其党员身份的有效性可能受到质疑，甚至可能被视为自动放弃预备党员资格。

结论与建议

综合以上分析，预备党员超过预备期后转组织关系再转正，存在较大困难，且程序上存在瑕疵。具体处理方式如下：

及时沟通：您应立即与原所在党组织取得联系，说明情况，请求其出具相关说明材料，解释为何未在预备期满时及时讨论您的转正问题。

补办手续：原党组织应根据实际情况，决定是否需要补办延长预备期或取消预备党员资格的手续。如果决定转正，需由原党支部召开支部大会讨论通过，并报上级党组织批准。

组织关系转接：在完成上述补办手续后，原党组织方可为您办理组织关系转接。接收党组织在审查您的材料时，会重点关注原党组织对您超过预备期情况的说明和处理决定。

风险提示：如果预备期过长且无正当理由，原党组织可能无法为您补办转正手续，您的预备党员资格可能被取消。因此，时间拖延越久，风险越大。

总结：预备党员超过预备期后，转组织关系和转正均需由原党组织先行处理，补办相关手续。您需要立即与原党组织沟通，说明情况，争取其出具说明并补办转正或相关处理手续。否则，您的预备党员资格可能无法得到承认。